Xã Ẳng Nưa được thành lập năm 1967 trên cơ sở một phần diện tích và dân số của xã Mường Ẳng[3].

Năm 1997, chính phủ điều chỉnh 502 ha diện tích tự nhiên và 2.900 người của xã Ẳng Nưa để thành lập thị trấn Mường Ẳng (sau đổi tên là thị trấn Mường Ảng). Xã Ẳng Nưa lúc này còn lại 2.880 ha diện tích tự nhiên và 3.011 người[4].

Theo kết quả Tổng điều tra dân số năm 1999, xã Ẳng Nưa có dân số 2.416 người[5].

Năm 2006, chính phủ điều chỉnh 2,604 ha diện tích tự nhiên và 58 người của xã Ẳng Nưa về thị trấn Mường Ảng, đồng thời xã Ẳng Nưa được chuyển từ huyện Tuần Giáo về huyện Mường Ảng mới thành lập[1].